《四月一日灵异事件簿第二季》讲述能看见妖怪的四月一日君寻误入了别名为“次元的魔女”并自称为壹原侑子所拥有的能够实现任何愿望的店。而当时四月一日正为自己能够看见妖怪而烦恼，而侑子说只要四月一日能付出对等的代价，就可以帮助四月一日实现。因此，四月一日答应侑子的条件，而侑子就开出让四月一日在其店中“打工”作为代价，而实现其愿望。四月一日在侑子的店中的打工期间却频繁遇到怪异事件……